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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

数字经济论坛：推动数字经济健康快速发展******

　　【分论坛焦点】

　　光明日报乌镇11月10日电（记者张晓华）“互联网基础资源是推动数字经济发展的重要基石，要进一步发展相关的技术和产业。”11月10日，中国互联网络信息中心主任曾宇在2022年世界互联网大会乌镇峰会数字经济论坛上建议。

　　“数字经济与农业经济、工业经济并不对立，也不是区别于实体经济的所谓虚拟经济，所有的行业领域都会涉及数字化转型。”伏羲智库创始人李晓东认为，数字经济发展强调生态开放，一方面，开放生态构建有利于实体经济沉淀数据资产，进而实现数据驱动的数字化转型升级；另一方面，数据和应用解耦会增强数据的可转移性和生态的良性竞争，创新更多商业模式。

　　“很多人觉得密码技术影响效率与功能，我认为更多是因为没有用好密码技术。”中国科学院院士、中国密码学会理事长王小云表示，区块链技术灵活运用密码学的核心与体系，对数据进行自动化、智能化的组织维护，通过数据安全计算打通数据壁垒，挖掘数据价值，创新服务新范式。“密码技术与区块链技术融合发展，必将为数字经济高质量发展注入新活力、新动能。”王小云强调。

　　腾讯公司副总裁刘勇表示，以创新推动数字经济的新发展是数字科技企业的责任所在。“2020年第七次人口普查上云，700万普查员、10亿级人口的数据采集、15天完成数据采集报送，大幅提高了人口普查的效率和质量。”刘勇举例说。

　　论坛还公布了“携手构建网络空间命运共同体”征文活动成果。24篇优秀稿件汇编成《数字世界的共同愿景——全球智库论携手构建网络空间命运共同体》文集。

　　《光明日报》（ 2022年11月11日 08版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）